يستخدم المنغنيز بشكل رئيسي كمطهر، ومؤكسد دوائي، ومحفز وما إلى ذلك في المجال الطبي.
على سبيل المثال، برمنجنات البوتاسيوم هي واحدة من المطهرات الأكثر استخداما في الطب لأنها مادة مؤكسدة قوية جدا. يمكن أن يلعب محلول برمنجنات البوتاسيوم بنسبة 0.1%+ دورًا في التطهير والتعقيم. بالإضافة إلى استخدامه كعامل مؤكسد وسيط في عملية إنتاج المسكنات، يستخدم المنغنيز أيضًا كمحفز لإنتاج الفيناسيتين المسكن الخافض للحرارة.
كما يمكن استخدام المنغنيز في المجال الطبي لتحضير بعض الأدوية وتركيبات الأدوية، مثل بعض الأدوية المستخدمة لعلاج نقص المنغنيز. بالإضافة إلى ذلك، يمكن للمنجنيز أيضًا أن يلعب دورًا محفزًا في صناعة المستخلصات النباتية.
تضيف الكثير من شركات الصيدلة المواد الكيميائية الموجودة تحت المنغنيز في عملية إنتاجها: